Доработка xray: Тюнинг и доработки Lada XRAY

Содержание

Замена прокладки коллектора Лада XRAY. Доработка впускного коллектора двигателя Lada Vesta CNG

Комментарии к теме Замена прокладки коллектора Лада XRAY

Muhammad

хороший человек расказывает все хорошо спасибо большое

Ришат

У сына с прокладкой коллектора на ЛАДА до сих пор все норм >) Так масло в коллекторе собирается из за прокладок этих?

Muti

Иван, приветствую. Подскажи пожалуйста, когда дымить начало, машина как ехать стала?? Тяга пропадала или нет?? Заранее спасибо.

Анбар

мы на девятке протягивали головку в итоге около 13 кгс получилось) Желательно в деталях рассказал бы по прокладке коллектора!

Dael

Спасибо парни. Все разжевали и в рот положили.

Белогорец Жуан

Проще заслонку сдернуть, зачем коллектор снимать.

Dack

Выкладывай любой полезный материал,не обращай внимания на диванных умников?? продолжай в том же духе,отличный контент! Редкие проблемы с прокладкой коллектора куда ни шло )))

Борислав

Ребята, вам похоже магазин автозапчастей заплатил, при таком способе легко сгорает ДМРВ. Его нужно отключать.

Афоня

Толковый ролик. Сегодня такое произошло. С глушака белый дым. Перед этим выплеснуло тосол из бачка. Грешил сначала на термостат, а когда увидел белый дым, то понял…

Асиф

Выехал из салона на новеньком РИО проехал 5 метров и катализатор рассыпался, двигатель сразу застучал и заклинил, дилер сказал что не гарантийный случай, виновен плохой бензин. Купил диммексид залил в бак и к каждый цилиндр и один внутрь принял. После нескольких попыток завестись, машина завелась, оставил поработать на полчаса, через пол часа мотор работал как новый, официалы были в ШОКЕ когда замерили мощность оказывается она выросла на 300 л.с. И еще один плюс теперь машину можно заправлять обычной водой из лужи, экономия на лицо!!! Неплохо, если более обстоятельно показал бы по прокладке коллектора на лада Ж))

Ишим

Привет. У меня чери фора, менял гидрики, и на гидрики сломалась защелка, она сломалась пополам. И одна половинка упала в отверстие. Что может произойти?, возможно, что пробка магнитная поймает этот кусочек? Вот ссылки на фото для понятности:

Faruq

Абсолютно такой же звук и диагноз недавно имел неудовольствие получить. Поршень долбит о стенку цилиндра. Двигатель под замену, судя по всему. У сына и без прокладки коллектора на lada куча чем заняться можно 😉

Вали

да, расход топлива’ испортил весь интерес

Стысин Лазиз

Легче сделать льву минет, Попасть к Вове в кабинет, Себя в жопу целовать, Чем Каптюру свечи поменять

Quan

-Я себе менял вчера вентилятор,  который охлаждает двигатель,сгорела обмотка, с завода мне поставили китайский за две тыс. купил поставил корейский оригинал за 4500 т. надеюсь больше не будет такой проблемы кстати пробег машины 50 тыс. Периодические трудности с прокладкой коллектора уже напрягают )

Измит

Не все ли разве уже этой ГБЦ?

Зуй Домот

Етому мотору лет 70 фильтра на новых движках серёзных с большым обёмом сменный карттыдж как на старой волге и головки и поршньи и даже вал с грм 417-402 подходят друг друг другу. Етот екземпляр второго или третего поколение с валом от умз 421 обём 2.9 разница вместо набивки сальник и прокладка поддона есть целая вместо кусковой движок неприхатливый и всеядный но прожорлевый… Мне приятель сказал на иксрей с прокладкой коллектора пока без особых проблем.

Похожие видео по ремонту

Lada XRay — шикарные доработки настоящих дизайнеров и мастеров тюнинга | Автострастный

Дизайнерам ВАЗа и не снилось

Дизайнерам ВАЗа и не снилось

Со времен начала своего существования, автозавод ВАЗ производит весьма спорное впечатление. Кому-то нравятся почти все модели, вышедшие из под пера местных дизайнеров. Но большая часть населения России все же остается недовольной, что внутренними показателями этих авто, что, тем более, их внешним видом. И вроде бы дизайнер у них, на ВАЗ, должен быть не один, и бюджет на разработки выделяется, но что-то здесь не то. Видать, раз такой формат проходит, на работу там можно устроиться только через родственников.

Lada stens, вот что улучшит продажи

Lada stens, вот что улучшит продажи

Среди прочих вариантов, Lada XRay, выпущенная сравнительно недавно, в 2015 году, получилась еще ничего — красивые рельефные узоры по бокам, современные формы фар и прочие элементы вывели этот автомобиль на новый уровень восприятия. Однако и тут можно увидеть свои недостатки. Первое, что бросается в глаза — большие габариты автомобиля и его высокая посадка. На самом деле эти качества только приветствуются среди автомобилистов, но в этом случае весь вид портят колеса, слишком маленькие для машины, созданной в таком стиле.

Выглядит не хуже Mitsubishi

Выглядит не хуже Mitsubishi

Конечно, для идеального образа можно было бы подправить и кое-что еще, сделав из XRay конфетку. И именно эта идея посетила одного столичного жителя, по совместимости обладающего автомобилем Lada XRay. Глядя на фото отчетливо видно, что его затея удалась. За проект взялась тюнинговая мастерская Big Up Workshop. В самом начале ими было решено занизить подвеску. Для достижения цели потребовалось устанавливать больше десятка разных донорских подвесок, пока одна, от Toyota Altezza, наконец-то все-таки подошла!

Не важно, что Lada, главное как представлена

Не важно, что Lada, главное как представлена

Другая мастерская, с названием Flow Runner, вообще пошла на эксперимент огромного масштаба. Экстремальные ребята настолько расширили кузов авто, что стандартная XRay сразу же превратилась в машину спортивного стиля стенс. Оригинальные колесные арки также пережили преобразование — их подпилили, и установили сверху эксклюзивные фендеры с модным креплением внешнего типа. Что же касается колес, то с помощью дисков Rays Volk Racing TE37 этот недостаток был исправлен просто феноменально! Теперь на этот автомобиль действительно приятно смотреть.

Креативное фото, аж XRay захотелось прикупить

Креативное фото, аж XRay захотелось прикупить

Поддержите, чтобы в статьях было видео

Замена сальника коробки передач Лада XRAY своими руками. Доработка Лада Веста.Ручка КПП

Комментарии к теме Замена сальника коробки передач Лада XRAY

Эльшад

Сальник заменил, это хорошо, а вот подшипник? Если уж маховик убрал то по ходу и подшипник желательно поменять. Или я ошибаюсь?

Дим Фильчаков

2:33 крышка раз… 3:08 крышка два. Ха-ха-ха! Маленькое наложение… Ничего страшного!

Вист

… чего вы … до слова колхоз,причём тут коллективное хозяйство и твой уеьишьнвй ховер?()

Чернава

А как можно с вами созвониться?

Мошонец Дом

может ли из-за изношенных втулок кулисы передача включаться с хрустом?

Захар

Если снимается поддон, то левый привод можно вытолкнуть изнутри

Бэк

Здравствуйте. Подскажи пожалуйста какого диаметра было спец сверло

Lev

перед заменой надо было пихнуть монтажку в эти два зазора по очереди и пошевелить. трещины если увидите то замена. а вы живую опору сменили на говно.

Фитюткин Рюрик

2:18 справа на запаске сзади стоящего авто

Akir

Всё сделал Как надо всё равно обороты плавают что делать?

Изаксон-Елизаров Арам

без Динамометрического ключа даже близко к гидроблоку не приблежайтесь.

Отабек

не могу устранить эту болячку,меняю сальник на новый а масло течёт, не пойму в чем причина

Эмил

Сан Саныч! Видос как всегда. Лайк! 🙂

Carmelo

Андрей привет.При включении зажигания был писк в заслонке, подумал что неисправность,фишку высунул и вставил назад.Писк ушёл,загорелся чек.Что делать?

Амирхан Бордюк

так держаться спс за полезное видео!

Мерида

Дануууу наааа!!! Коля ты чтоли!!! Ептаа!!! =)

Филипп

ВЫРУЧАЙТЕ ДРУЗЬЯ.! Что может быть бмв е 39 м 52 б 25 первая скорость не включается после того как машина прогреется на холодную все отлично включается??? Сцепление заменили. Сцепление выжимаешь и чуть чуть приотпускаешь и уже хочет трогаться ведь не должно быть так??? Что до замены что после.Что еще???

Манана Бервецкая

а конусы ведь можно шлифануть и полностью убрать задиры?

Принцесса

В патриоте теперь тоже есть такая штука?

Истюфеев Дубовик

А если со шрусом все норм…а при разгоне с 0 начинается сильный гул вибрация… как опускаешь газ едешь накатом все норм… авто мазда 3 2005 год 2.3л подушки целы глушак в норме… посоветуйте пж.

Инал

Правильно, с друзей надо брать в 10 раз дороже) 1. Снять кузов в профильном сервисе 17к. Можно найти и 15к. За 40к — это полный развод, если официалы снимают за 20…25 2. Снимать кузов только для ремонта двигла, турбины или коробки, а вовсе не ‘для всех работ’. Т. е. когда машину ушатали. Ремень навесного — без снятия кузова, замена масла, свечей тоже.

Муз Шигонцев

Отличное видео. Все коротко и предельно ясно!

Гарран Дар

Размер салька подскажите пожалуйста

Ильгизар

А подскажи тело новые кольца как правильно устанавливать,или нету принципиальной разницы

Дрозд

Уважаемый, подскажите пожалуйста. У меня такая же машина. Появилась проблема с движком. Ощущение, что сильно стучат клапана при движении и при холостом ходе. Хотя появилось мнение, что растянулась цепь. Пробег 115000 км. Как избавиться от стука лишнего. И КПК дроссельную заслонка промывать?

Написать комментарий

Тюнинг и доработки Lada XRAY » Страница 6

Внешний тюнинг лада х рей | интернет-магазин motorring

LADA XRAY – первый кроссовер от АВТОВАЗа. И первый же автомобиль марки, который получил новый фирменный стиль «X-face» от всемирно известного дизайнера Стива Маттина. Впервые, «шоу-кар» LADA XRAY Concept был показан в 2020 году. Тогда он представлял собой концептуальный полноразмерный кроссовер с тремя дверьми. Позже, в 2020 году, на Московском международном автосалоне (ММАС-2020) был представлен LADA XRAY Concept номер два. Этот демонстрационный автомобиль представлял собой компактный кроссовер и уже почти серийный автомобиль, который впоследствии был построен на платформе альянса «Renault-Nissan» B0.

 

Многие восхищаются дизайном новой модели АВТОВАЗа, а некоторым «Иксрей» кажется несуразным из-за непропорциональных кузову колес. Но равнодушных к этой модели, кажется, нет. В любом случае автомобиль, как и Vesta, являются машинами нового поколения LADA. А яркая внешность и претензия на внедорожные способности модели, вероятно, будут провоцировать владельцев на тюнинг. Мы, правда, не готовы прогнозировать, насколько актуальны для «Иксрея» будут переделки внешнего вида и, соответственно, спрос на такие товары, как:

  • евроручки
  • бамперы передние
  • бамперы задние
  • накладки на пороги
  • альтернативные боковые зеркала
  • пластиковые накладки
  • решетки радиатора в бампер
  • сабли
  • реснички на фары
  • накладки на фонари

А вот качественно преобразить внешний вид кроссовера помогут:

  • альтернативная передняя и задняя оптика
  • спойлеры

 Больше всего для внешнего тюнинга  XRAY подойдут товары, расширяющие его функциональные и внедорожные возможности:

  • молдинги на двери
  • пороги
  • фаркоп
  • кенгурятники
  • защита (накладка) переднего и заднего бамперов
  • багажник на крышу
  • защитная накладка на задний бампер

Замена крышки бензобака

Топливный бак Lada X Ray огорчает всеобщей доступностью и возможностью открыть его без всякого участия человека за рулём. Приемлемым решением вопроса будет установка пробки на топливный бак с замковым устройством.

Защита порогов с площадками

Установка этих элементов особо эффектна в комплексе с защитой переднего и заднего бамперов. Защита порогов выполняется также из нержавеющей стали, а площадки – из дюрали. Эти элементы тюнинга не только позволяют отряхнуть обувь от грязи и снега перед посадкой в салон, но и не боятся вертикальных нагрузок – опорные кронштейны из стали жёстко крепятся к кузову.

Монтаж рейлингов

Установка рейлингов на крышу кроссовера позволит использовать в поездках современный обтекаемый багажник – желанный для владельцев машин этого класса аксессуар.

С декабря 2020 г. рейлинги для Лада Икс Рей можно приобрести в интернет-магазинах вместе с комплектом креплений, позволяющим установить их без сверления крыши.

При монтаже рейлингов следует учесть, что место установки не рассчитано на дополнительную нагрузку и не содержит усиления, поэтому крышу автомобиля изнутри необходимо как-то усиливать стальными накладками или рёбрами жёсткости.

Так как Lada X Ray создан на базе Renault Sandero Stepway, то рейлинги этого автомобиля также вполне подойдут для Икс Рей.

Кроме того, донором этих аксессуаров может стать и Infiniti FX 37, имеющий такие же характеристики крыши.

Обвес от юролтюнинг

Тольяттинская фирма «Юролтюнинг», занимающаяся изготовлением стайлинговых комплектов из АБС-пластика, в декабре 2020 года представила комплект тюнинг обвеса для Lada XRAY:

  • Бампер передний 
  • Обтекатель радиатора 
  • Накладки на пороги 
  • Спойлер
  • Накладка на задний бампер

Представленный передний бампер для Lada XRAY дополнен обтекателем на радиатор, (можно без него), он формирует правильный поток воздуха на радиатор, закрывая внутренности моторного отсека, и защищая его таким образом от грязи и пыли.

Для установки бампера потребуется небольшая доработка кронштейна. Она не повлияет в дальнейшем на установку штатного бампера, и не несет в себе никаких глобальных изменений в конструкции вашего автомобиля.

Видео обзор обвеса:

Купить от производителя можно в нашем интернет-магазине.

Напомним, изменить экстерьер Lada XRAY можно и другими способами. Например, установить накладку на передний бампер, Кросс-обвес или металлические трубы из нержавеющей стали.

Ключевые слова: бампер lada xray | решетка радиатора lada xray | спойлер lada xray

132

Обнаружили ошибку? Выделите ее и нажмите Ctrl Enter..


  • Первые живые фото Lada Largus FL, новые подробности

  • Особенности подвески Lada Granta и Lada Kalina

  • Устройство и отзывы о печке (отопителе) Lada XRAY

  • Как разобрать фару на Лада Гранта, Калина 2 (заменить стекло, маску)

Перепрошивка двс

Тюнинг двигателя Лады Х Рей на установке выше перечисленных комплектующих не заканчивается – необходимо произвести чип-тюнинг ЭБУ (электронного блока управления), то есть перепрошивку «мозгов».

Для Lada X Ray целесообразно выбрать одну из уже проверенных прошивок: Ledokol, Adact или Paulus. Чип-тюнинг добавит автомобилю динамики при незначительном повышении расхода топлива и снизит содержание вредных веществ в выхлопных газах.

Самостоятельное внесение автовладельцем изменений в ЭБУ влечёт досрочное прекращение гарантийных обязательств со стороны дилера.

Тюнинг двигателя

Самым мощным ДВС, устанавливаемым на Лада X Ray, является 16-клапанный ВАЗ-21179 объёмом 1,8 л и мощностью 122 л.с. Устройство двигателя позволяет без ущерба ресурсу довести его мощность до 150 л.с.

Для этого на двигателе производится установка спортивного ресивера для оптимизации поступления воздуха в цилиндры

с заменой штатных распределительных валов и клапанов спортивными комплектующими.

У двигателя есть также техническая возможность установки турбины, компрессора, но их применение будет эффективным лишь при замене ВАЗовской КПП, не позволяющей выдать более 180 НМ крутящего момента.

Тюнинг защиты картера

Все версии Lada X Ray оснащены защитой двигателя снизу, которая свою защитную функцию выполняет неплохо. Но в штатном изделии не предусмотрено технологическое отверстие для слива масла при его замене, что вынуждает снимать-устанавливать брызговик при выполнении этой процедуры. Поэтому установка тюнингованной, более функциональной защиты сэкономит время при замене масла, к тому же есть возможность выбрать этот элемент из стали большей толщины.

Тюнинг и доработки lada xray » страница 3

Тюнинг на лада x ray (икс рей) купить с доставкой по рф | тюнинг-пласт

Тюнинг подвески lada x ray

Конструктивно что-то менять в подвеске кроссовера не имеет смысла – платформа надёжна и достаточно совершенна. Но с увеличением пробега её элементы, также неплохого качества, выходят из строя. И заменить их можно на комплектующие с соответствующими характеристиками, но от других отечественных или зарубежных автомобилей.

Тюнинг салона

Салон Лада Икс Рей, особенно передняя его просторная часть, позволяет повысить функциональность отделки.

Например, установка на переднюю панель такого простого аксессуара, как органайзер, позволит водителю разместить в видимой доступности множество мелочей, вместо того, чтобы искать их на ощупь в бардачке, картах дверей или под сиденьями.

Крепление органайзера производится двусторонним скотчем и позволяет при необходимости быстро снять этот аксессуар.

Повысить комфорт среды в салоне можно, увеличив эффективность работы вентилятора отопителя. Конструктивно вентилятор находится перед фильтром и гонит на него мусор, попадающий через воздухозаборник из-за отсутствия на нём защитной сетки. Фильтр быстро забивается, и тепло через дефлекторы поступает в салон плохо.

Решение проблемы несложное – в установке сетки и попутной наклейке на вентилятор манделина (для снижения шума его работы), но предполагает обращение к официальному дилеру.

Как уже было сказано, потенциал для тюнинга у Лада Х Рей большой, и из этого не следует, что у кроссовера много недоработок. Хорошее всегда хочется сделать ещё лучше, и тюнинг Lada X Ray лишь подтверждает его перспективность.

Тюнинг х рей

Установка дефлектора капота

Дефлектор (мухобойка) служит для защиты передней кромки капота от летящих навстречу камешков, насекомых и прочего мусора. Как правило, выполняются они из пластика, прочности которого достаточно для такой защиты. Но, даже если дефлектор будет повреждён значительно, это убережёт от повреждений капот.

Установка защиты бамперов

Не секрет, что бамперы Лада Икс Рей являются скорее декоративным элементом оснастки кузова, чем защитным. К тому же, сложность конфигурации создаёт проблемы при его восстановлении, а мелкие повреждения при парковке снижают эстетичность. Поэтому установка дополнительной защиты бамперов, а в какой-то степени и кузова – решение вполне рациональное, особенно если его исполнение неплохого качества.

Установка фаркопа

Штатная комплектация кроссовера не предусматривает оборудование автомобиля буксирующим устройством, которое при буксировке прицепа незаменимо. Поэтому в продаже имеется комплект производства АвтоВАЗ, включающий фаркоп со всем необходимым крепежом, рассчитанный на установку по штатному месту расположения без дополнительного сверления или иной доработки. Конструкция устройства позволяет легко демонтировать только крюк крепления буксира без демонтажа всего узла.

Предельный вес буксируемого прицепа не должен превышать величины, указанной в инструкции по эксплуатации Лада Икс Рей – 1100 кг.

Установка шин большего размера

Вместо штатных 15- и 16-дюймовых легкосплавных дисков колёсные арки Lada X Ray позволяют установить более эффектные для кроссовера 17- 18- и даже 19-дюймовые диски, шиноразмеры для которых будут следующими:

  • R17 – 185/55, 195/50, 205/50;
  • R18 – 175/50, 195/45, 215/40;
  • R19 – 175/45, 185/40, 195/40.

Следует отметить, что диски размером 19 дюймов требуют использования низкопрофильных шин, которые делают их уязвимыми для дефектов дорожного покрытия.

Lada XRAY Cross получила ряд уникальных доработок :: Автопортал Третий Рим

30 августа 2018

Продажи новой версии начнутся под конец года


Александр Шаронов, фото «Авторевю»

Lada XRAY изначально презентовалась в качестве компактного кроссовера. Теперь на Московском международном автосалоне представлена новая версия XRAY Cross. Получается какой-то кросс-кросс! Чем эта тавтологичная новинка отличается от базовой модели?

Несмотря на общий стиль, Lada XRAY и «Веста» построены на разных платформах. Если для «Весты» использована своеобразная сборная солянка, которую «АВТОВАЗ» может именовать собственной архитектурой, то в основе XRAY легендарная «тележка» B0. Поэтому Lada XRAY и по своим пропорциям, и по ездовым повадкам так похожа на Renault Sandero Stepway.


Тем не менее, в XRAY Cross инженеры «АВТОВАЗа» использовали ряд оригинальных решений. Так, в передней подвеске типичные для B0 нижние рычаги уступили место новым L-образным. В дополнение к этому вместо электрогидравлического усилителя руля установлен электрический, а рулевая колонка получила регулировку по вылету. Этими решениями XRAY Cross напоминает «Весту».

Плюс к этому на Lada XRAY Cross появились задние дисковые тормоза. Практически уникальное событие по меркам платформы B0: во всех моделях на ее основе используются «барабаны» (исключения касаются только редких региональных спецверсий).

За счет повышения размерности шин до 215/50 R17 удалось увеличить дорожный просвет со 195 до 215 мм: владельцы большинства традиционных кроссоверов обзаведутся!


В салоне XRAY Cross можно обнаружить еще одно напоминание о том, что новинка из всех сил старается стать автомобилем для настоящего оффроуда: хэтч получил шайбой выбора режимов работы системы стабилизации с пятью позициями: обычный, спортивный, зимний, для песка и без стабилизации.

Разумеется, о появлении полноприводных версий Lada XRAY Cross не стоит даже заикаться. Но в целом подход к разработке кросс-версии импонирует. Зачастую в таких случаях производители обходятся лишь обвесом из некрашеного пластика (у новинки он тоже есть), да более «мясистыми» покрышками.

Продажи Lada XRAY Cross начнутся ближе к концу года. Цены пока не объявлены.


Снятие обшивки багажника Лада XRAY. Доработки Х Рей. Отремонтируем и обсудим

Комментарии к теме Снятие обшивки багажника Лада XRAY

Goodwin

нету что надо

Захтаренко Мангуш

А чё за анти лайки человек вроде от души. А авто электрикам на заметку да и делов.:-)

Вуд

добрый день, руки в масле я поменял лампу в акпп, но у меня не горить,что то не понял думаю наверно авто электрику обращатся.

Идеал Скребов

Собираю себе сейчас на таврию сейчас мне 17 думаю в 18 я буду щясливым обладателем таврюшки 🙂 удачки тебе с твоей машинкой 🙂

Devan

Поздравляю Юрия и всех зрителей с Днем автомобилиста!!!

Рейд

Отличное видео, спасибо) поменял по твоей инструкции! Только я покупал на хрустики сами 🙂 посмотрим, как они прослужат.

Марсель

Их меняют по гарантии,дилеры в курсе.

Форсайт

ЯН ты как всегда крут) извини пожалуйста,а ты мог бы ответить на личное сообщение тут?) я на Facebook написал что то ты молчишь)

Флюр

Мля дружище, ты бы к офтальмологу сходил. Глаза друг друга нах посылают

Nawaf

Спасибо за видео! Теперь разберусь со стопами.

Нада

по этим петлям скажу следующее: на них с завода устанавливаются резиновые обоймы, как и на петли дверей пассажиров и водителя, со временем они изнашиваются и рвутся. вот тем самым образуется зазор и люфт в результате чего получаем дребезг 5-ой двери. Выход простой наматываем изоленту — из личного опыта хватает на пол года. либо ищем заводскую резинку на петлю.

Leigh

Материал отстой

Дар

прикольно, и сколько такое добро стоит вместе с работой, тоже также хочу?)

Хамит Шклянский

Выписывал я себе такой моторчик для рэкса, у него есть одна проблема, полярность + и — нужно менять местами. Верно?

Aurea

Nissan Leaf замена динамика, разбор обшивки двери (подробно). Делал вчера. Видео отчёт тут

Гулчехра

Фиолетовую

Wekesa

Нууууу где продолжение?

Майлс Бычу

Друг привёз модуль из Москвы в Германию. Вчера установил на свой В70 2009 года, благодоря вашей инстукции заняло всё примерно 15 минут. Всё работает и с пульта и с ключа. А фишка, что при разблокировки дверей багажник закрывается, просто супер. Огромное спасибо вам, вашему каналу и вашему помощнику Евгению.

Макси

У меня 10 машине потолок грязный сильно, можно его снять и обтянуть новой тканью?

Илюха

Теперь понятно, что гремит под этой панелькой. Экономят на поролоне. Причем, гремит слева на прульной Latio.

Ден Нараевский

Легаси BH-5 99год не канает (

Ворон Олесик

как поменять прикуриватель на субару импреза2008

Данилина

конечно видео такие нужны только может по короче инфу подорвать нам уже по 18+

Анзор

Главное чтоб подушка не убила потом)

Вильдан

ребята,грузовички 0,7-1,8куб. обзорчик сделайте.

Bradd

А никто не в курсе как ограничитель скорости снять с джампера 100 едет и все.только без прошивки)

Sasha

Действительно руки из плеч!И не зажал секрет для людей.Подписываюсь.

Аша

Получилось отлично. Скажи как ты решил проблему со спинками? Когда их опускаешь они не ложатся в ровень, они заваливаются вниз и ровный пол не получается.

Написать комментарий

Lada Xray 2022 показан на новом рендере с обновлением

В прошлом месяце компания «АвтоВАЗ» официально презентовала рестайлинговую версию своего флагмана Lada Vesta. Модель получила новое оснащение и скорректированный внешний вид. Но что, если бы обновился и Lada Xray 2022. Как бы выглядел российский хэтчбек после рестайлинга? Дизайнеры портала Quto.ru представили рендеринг такого автомобиля.

Модель на визуализации во многом схожа с обновленной «Вестой» (фото: Quto.ru). Спереди установлены широкие светодиодные фары, в корпуса которых зигзагом заходят края хромированного молдинга. Между оптикой расположена среднего размера решетка радиатора с наполнением в виде пчелиных сот. К слову, последний элемент получила модель Vesta SW Cross, показанная в конце прошлого месяца. Профиль автомобиля остался без изменений. Там старые классические диски «Лада» и Х-образная выштамповка на дверях. Корма новинки нарисована дизайнерами «с нуля». То есть они не добавляли детали от существующих новинок, а сами придумали, какие бы доработки получил хэтчбек в задней части кузова. Там установлены фонари с новым оформлением, небольшой спойлер и бампер с металлической накладкой, в которую интегрированы прямоугольные выхлопные патрубки.

Художники не создали рендеринг интерьера новинки, но можно предположить, что там были бы такие же доработки, как у новой «Весты». Напомним, салон флагмана после рестайлинга еще официально не демонстрировали. Но в Сети неоднократно появлялись шпионские фотографии. Новый Lada Xray мог бы получить большой вертикальный дисплей мультимедийного комплекса, цифровую «приборку» и модуль настроек климат-контроля от Renault Arkana.

Однако рестайлинговый Lada Xray всё же не стоит ждать, а это лишь фантазия дизайнеров. Недавно в пресс-службе компании «АвтоВАЗ» сообщили, что отечественный хэтчбек никогда не получит обновление. То есть машина доживет свой коммерческий цикл и будет снята с производства. Это должно случиться примерно в 2025 году. Данное решение вполне логично, ведь машина пользуется очень низким спросом в РФ, и нет смысла тратить деньги и силы инженеров на проведение её рестайлинга.

Рентгеновская кристаллография – Уточнение

Уточнение

После начального фазировка и построение , модель белка вообще далека от идеального. Чтобы улучшить фазы, а также интерпретацию методы уточнения карт электронной плотности являются очень важным шагом в интерпретация дифракционных данных. После доработки дополнительная перестройка раунды обычно необходимы.

Переработка достигается за счет статистической корректировки атомных координат для лучшего соответствия дифракционным данным.В качестве меры подгонки «работа Используется R-фактор, который измеряет, насколько далеко расчетные амплитуды отличаются от наблюдаемых амплитуд. «Р-фактор работы» может попасть в ловушку локальных минимумов, создав ложное впечатление о хорошем модель. По этой причине свободный R-фактор в основном используется для проверки процесс уточнения. Коэффициент рассчитывается из 5% отражений которые исключены из уточнения, и поэтому дает независимую мера прогресса уточнения.Падение R-факторов во время уточнение более важно, чем фактическое значение, но, как правило, окончательное значения лежат между 15% и 25%, при этом свободный R-фактор немного выше чем рабочий R-фактор.

Два метода широко используются при уточнении: максимальная вероятность и имитация отжига . Оба метода используют ограничения на то, как атомная модель должна выглядеть в отношении расстояний связей, углов кручения и температурные факторы (В-факторы).С максимальной вероятностью фазы регулируются для минимизации R-фактора. В имитации отжига структура «нагревается» для придания хаотичности и медленно охлаждается и изысканный. Случайность снижает вероятность попадания в неправильный локальный минимум.

Дополнительный методы могут улучшить карты. Некристаллографическая симметрия (NCS) ограничители усредняют фазы в симметричных частях (разные молекулы) асимметричного звена. Модификация плотности (DM) направлена ​​на то, чтобы настроить плотность в соответствии с ожиданиями того, как она должна в целом выглядит как. Растворитель не дифрагирует нормально, и плотность электронов поэтому должен быть равен нулю в области растворителя. В белке часто бывает температура факторы усредняются по всем измерениям (изотропные) вместо индивидуальных (анизотропный). TLS уточнение (для перевода, либрации (небольшие движения) и винтовое вращение группы атомов) может дать хороший приближение анизотропии с гораздо меньшим количеством параметров.Группа TLS атомов может быть целой молекулой или доменом.

ПРОГРАММЫ

РЕФМАК, уточнение максимального правдоподобия
Phenix, включает симуляцию отжиг
Пират
Попугай
Список дополнительных программ

ССЫЛКИ

ЦИМР Курс белковой кристаллографии (уточнение)
CIMR Курс белковой кристаллографии (модификация плотности)

Что такое уточнение в рентгеновской кристаллографии? – Сделано в сборе.ком

Что такое уточнение в рентгеновской кристаллографии?

Рентгеноструктурное уточнение кристаллической структуры, которое представляет собой процесс достижения согласия между структурной моделью и экспериментальными данными (структурные факторы и карты электронной плотности), обычно занимает месяцы, а иногда и годы.

Что такое рентгеновская кристаллография Как получают изображения?

Рентгеновская кристаллография белков Образующиеся кристаллы замораживают в жидком азоте и отправляют в синхротрон, который представляет собой мощный перестраиваемый источник рентгеновского излучения.Их монтируют на гониометр и облучают пучком рентгеновских лучей. Данные собираются, когда кристалл поворачивается на несколько углов.

Как рентгеновская кристаллография используется для определения структуры белков?

Рентгеновская кристаллография белков — это метод, используемый для получения трехмерной структуры определенного белка путем рентгеновской дифракции его кристаллизованной формы. Создание кристаллов создает решетку, в которой этот метод объединяет миллионы белковых молекул, чтобы сделать сбор данных более чувствительным.

Из чего состоит хорошая кристаллическая структура?

Хорошая структура показывает максимумы остаточной плотности в центрах кольцевых связей. Это связано с тем, что отклонение от сферической атомной плотности из-за эффектов связывания, как правило, не учитывается в уточняемом наборе параметров модели. На узлах атомов не должно быть заметных максимумов плотности.

Какие существуют типы кристаллической структуры?

Каждая кристаллическая решетка определяется кристаллической системой.В трех измерениях существует семь кристаллических систем: триклинная, моноклинная, орторомбическая, гексагональная, ромбоэдрическая, тетрагональная и кубическая. Эти наборы систем называются решетками Браве.

Что такое уточнение TLS?

Уточнение TLS

предназначено для обеспечения простого описания анизотропных смещений, когда разрешение недостаточно хорошее, чтобы оправдать уточнение атомарных ADP.

Как рафинирование используется в рентгеновской кристаллографии?

В макромолекулярной рентгеновской кристаллографии значения уточнения R измеряют соответствие между наблюдаемыми и расчетными данными.Аналогичным образом, для оценки качества данных используются значения R(объединения), сообщающие о соответствии между несколькими измерениями данного отражения.

Как рентгеновская кристаллография используется для отслеживания аминокислот?

Рентгеновская кристаллография: от карты электронной плотности к структуре белка Задание: Проследить последовательность аминокислот в белке с помощью трехмерной карты электронной плотности. Сложные белковые структуры и некачественные карты плотности могут потребовать больших усилий от кристаллографа. Было бы здорово, если бы мы могли автоматизировать этот процесс!

Почему важны рентгеновские данные для уточнения и осаждения?

NIH X-ray Interest Group: Информационный бюллетень ОБСУЖДЕНИЕ ТЕМЫ – Данные для уточнения и осаждения/публикации Синьхуа Цзи (NCI): Данные с высоким разрешением, даже неполные, всегда помогают улучшить электронную плотность, что позволяет выявить дополнительные структурные особенности.Поэтому полезно включать в уточнение больше данных.

Какой метод улучшения структуры лучше всего?

Уточнение структуры. Уточнение методом наименьших квадратов. Метод уточнения, наиболее часто используемый в кристаллографии малых молекул, представляет собой уточнение по принципу наименьших квадратов. Предположим, что z является линейной функцией переменных x n и параметров p n, которые определяют функцию. z = p 1 x 1 + p 2 x 2 + + p n x n

Рентгенологическое уточнение значительно занижает уровень микроскопической неоднородности в биомолекулярных кристаллах

  • Berman, H.М., Клейвегт, Г.Дж., Накамура, Х. и Маркли, Дж.Л. Будущее банка данных о белках. Биополимеры 99 , 218–222 (2013).

    КАС Статья Google ученый

  • Хенцлер-Вилдман К. и Керн Д. Динамические свойства белков. Природа 450 , 964–972 (2007).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Хрущ М., Wlodawer, A. & Minor, W. Определение белковых структур — серия удачных событий. Биофиз. J. 95 , 1–9 (2008).

    КАС Статья Google ученый

  • Крушел, Д. и Загрович, Б. Конформационное усреднение в структурной биологии: проблемы, проблемы и вычислительные решения. Мол. Биосист. 5 , 1606–1616 (2009).

    КАС Статья Google ученый

  • Рейто П.А. и Фрир, С. Т. Конформационные подсостояния белков по данным рентгеновской кристаллографии. Прог. Биофиз. Мол. биол. 66 , 167–196 (1996).

    КАС Статья Google ученый

  • Рейдер С.Д. и Агард Д.А. Конформационные подсостояния в механизме фермента: структура 120К альфа-литической протеазы с разрешением 1,5 ангстрем. Науки о белках. 6 , 1375–1386 (1997).

    КАС Статья Google ученый

  • Уилсон, М.A. & Brunger, AT. Кристаллическая структура 1,0 ангстрем кальмодулина, связанного с Ca 2+ : анализ беспорядка и последствий для функционально значимой пластичности. Дж. Мол. биол. 301 , 1237–1256 (2000).

    КАС Статья Google ученый

  • Бюрги Р., Питера Дж. и ван Гюнстерен В. Оценка влияния конформационного усреднения на измеренные значения наблюдаемых. Дж.биомол. ЯМР 19 , 305–320 (2001).

    Артикул Google ученый

  • Zagrovic, B. & Pande, V.S. Ансамбль, смоделированный в развернутом состоянии, и экспериментальные ЯМР-структуры головного убора виллина дают аналогичные широкоугольные профили рассеяния рентгеновских лучей раствором. Дж. Ам. хим. соц. 128 , 11742–11743 (2006 г.).

    КАС Статья Google ученый

  • Загрович, Б.Спиральный характерный мотив на картинах дифракции волокон цепочек случайных блужданий. Мол. физ. 105 , 1299–1306 (2007).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Куриян Дж., Петско Г.А., Леви Р.М. и Карплюс М. Влияние анизотропии и ангармонизма на кристаллографическое уточнение белка: оценка с помощью молекулярной динамики. Дж. Мол. биол. 190 , 227–254 (1986).

    КАС Статья Google ученый

  • Гарсия, А. Э., Крумхансл, Дж. А. и Фрауэнфельдер, Х. Вариации на тему Дебая и Уоллера: от простых кристаллов к белкам. Белки 29 , 153–160 (1997).

    КАС Статья Google ученый

  • Тан, К. Э. и Дилл, К. А. Флуктуации нативного белка: температура конформационного движения и обратная корреляция гибкости белка со стабильностью белка. Дж. Биомол. Структура Дин. 16 , 397–411 (1998).

    КАС Статья Google ученый

  • Дебай, П. Интерференция рентгеновских лучей и тепловое движение. Энн. физ. 43 , 49–95 (1913).

    Артикул Google ученый

  • Уоллер И. К вопросу о влиянии теплового движения на интерференцию рентгеновских лучей. З.физ. 17 , 398–408 (1923).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Lu, C.H. et al. О связи между структурой белка и динамикой белка. Белки 72 , 625–634 (2008).

    КАС Статья Google ученый

  • Karplus, P.A. & Schulz, G.E. Прогнозирование гибкости цепи в белках – инструмент для выбора пептидных антигенов. Naturwissenschaften 72 , 212–213 (1985).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Вихинен, М., Торккила, Э. и Рииконен, П. Точность прогнозов гибкости белков. Белки 19 , 141–149 (1994).

    КАС Статья Google ученый

  • Parthasarathy, S. & Murthy, M. R. N. Термическая стабильность белков: понимание параметров атомного смещения (значения B). Белок Eng. 13 , 9–13 (2000).

    КАС Статья Google ученый

  • Полянский А. А., Кузманик А., Хлевняк М. и Загрович Б. О вкладе линейных корреляций в квазигармоническую конформационную энтропию в белках. J. Chem. Теория вычисл. 8 , 3820–3829 (2012).

    КАС Статья Google ученый

  • Кунду, С., Мелтон, Дж. С., Соренсен, Д. К. и Филлипс, Г. Н. Динамика белков в кристаллах: сравнение эксперимента с простыми моделями. Биофиз. J. 83 , 723–732 (2002).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Исин, ​​Б., Тирупула, К.С., Олтвай, З.Н., Кляйн-Ситхараман, Дж. и Бахар, И. Идентификация движений в мембранных белках с помощью моделей эластичных сетей и их экспериментальная проверка. Методы Мол. биол. 914 , 285–317 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google ученый

  • Линдорф-Ларсен, К., Бест, Р. Б., ДеПристо, М. А., Добсон, К. М. и Вендрусколо, М. Одновременное определение структуры и динамики белка. Природа 433 , 128–132 (2005).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Гликос Н.М. О применении молекулярно-динамического моделирования для проверки тепловых параметров и оптимизации выбора TLS-группы для уточнения макромолекул. Acta Кристаллогр. D 63 , 705–713 (2007).

    КАС Статья Google ученый

  • Lu, W.C., Wang, C.Z., Yu, E.W. & Ho, K.M. Динамика тримерного белка-транспортера AcrB, полученная на основе B-факторного анализа кристаллической структуры. Белки 62 , 152–158 (2006).

    КАС Статья Google ученый

  • Kuzmanic, A. & Zagrovic, B. Определение среднего по ансамблю парного среднеквадратичного отклонения от экспериментальных B-факторов. Биофиз. J. 98 , 861–871 (2010).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Кузманик А., Крушел Д., ван Гюнстерен В. Ф., Панну Н. С. и Загрович Б.Динамика может существенно влиять на оценку межатомных расстояний в биомолекулярных рентгеновских структурах. Дж. Мол. биол. 411 , 286–297 (2011).

    КАС Статья Google ученый

  • Куриян Дж. и Вейс В.И. Движение жесткого белка как модель кристаллографических температурных факторов. Проц. Натл акад. науч. США 88 , 2773–2777 (1991).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Каруго, О.Корреляция между заполненностью и фактором B молекул воды в кристаллических структурах белка. Белок Eng. 12 , 1021–1024 (1999).

    КАС Статья Google ученый

  • Дрент, Дж. Принципы рентгеновской кристаллографии белков 3-е изд. Springer (2007).

  • Муршудов Г. Н., Вагин А. А., Додсон Э. Дж. Уточнение макромолекулярных структур методом максимального правдоподобия. Acta Кристаллогр. D 53 , 240–255 (1997).

    КАС Статья Google ученый

  • Муршудов Г.Н. и др. REFMAC5 для уточнения макромолекулярных кристаллических структур. Acta Кристаллогр. Д 67 , 355–367 (2011).

    КАС Статья Google ученый

  • Адамс, П. Д. и др. PHENIX: комплексная система на основе Python для решения макромолекулярной структуры. Acta Кристаллогр. Д 66 , 213–221 (2010).

    КАС Статья Google ученый

  • Яновский, П. А., Черутти, Д. С., Холтон, Дж. и Кейс, Д. А. Моделирование кристаллов пептидов раскрывает скрытую динамику. Дж. Ам. хим. соц. 135 , 7938–7948 (2013).

    КАС Статья Google ученый

  • Загрович Б., Сноу К.Д., Рубашки, М. Р. и Панде, В. С. Моделирование сворачивания небольшого альфа-спирального белка в атомистических деталях с использованием распределенных по всему миру вычислений. Дж. Мол. биол. 323 , 927–937 (2002).

    КАС Статья Google ученый

  • Черутти, Д. С., Ле Тронг, И., Стенкамп, Р. Э. и Лайбранд, Т. П. Динамика комплекса стрептавидин-биотин в растворе и в его кристаллической решетке: отличное поведение, выявленное молекулярным моделированием. J. Phys. хим. B 113 , 6971–6985 (2009).

    КАС Статья Google ученый

  • Hu, Z. & Jiang, J. Оценка биомолекулярных силовых полей для моделирования молекулярной динамики в кристалле белка. Дж. Вычисл. хим. 31 , 371–380 (2010).

    КАС Статья Google ученый

  • Петров Д. и Загрович Б.Микроскопический анализ окислительного повреждения белков: влияние карбонилирования на структуру, динамику и агрегационную способность ворсинчатых головок. Дж. Ам. хим. соц. 133 , 7016–7024 (2011).

    КАС Статья Google ученый

  • Kleywegt, G.J. & Jones, T.A. xdlMAPMAN и xdlDATAMAN — программы для переформатирования, анализа и обработки карт электронной плотности биомакромолекул и наборов данных отражения. Acta Кристаллогр. D 52 , 826–828 (1996).

    КАС Статья Google ученый

  • Бранден, К.-И. и Джонс, Т.А. Между объективностью и субъективностью. Природа 343 , 687–689 (1990).

    ОБЪЯВЛЕНИЕ Статья Google ученый

  • Виткуп Д., Ринге Д., Карплюс М. и Пецко Г. А. Почему белковые R-факторы такие большие: самосогласованный анализ. Белки 46 , 345–354 (2002).

    КАС Статья Google ученый

  • Furnham, N., Blundell, T.L., DePristo, M.A. & Terwilliger, T.C. Достаточно ли одного решения? Нац. Структура Мол. биол. 13 , 184–185 (2006).

    КАС Статья Google ученый

  • Бюрги, Х. Б. Движение и беспорядок в анализе кристаллической структуры: их измерение и различение. Год. Преподобный физ. хим. 51 , 275–296 (2000).

    ОБЪЯВЛЕНИЕ Статья Google ученый

  • van Gunsteren, W. F. et al. Биомолекулярное моделирование: цели, проблемы, перспективы. Анжю. хим. Междунар. Эд. англ. 45 , 4064–4092 (2006).

    КАС Статья Google ученый

  • Дрор Р.О., Диркс Р.М., Гроссман Дж.П., Сюй, Х. и Шоу, Д.Э. Биомолекулярное моделирование: вычислительный микроскоп для молекулярной биологии. Год. Преподобный Биофиз. 41 , 429–452 (2012).

    КАС Статья Google ученый

  • Berglund, G.I. et al. Каталитический путь пероксидазы хрена в высоком разрешении. Природа 417 , 463–468 (2002).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Бернли, Б.Т., Афонин, П.В., Адамс, П.Д. и Грос, П. Моделирование динамики кристаллических структур белка путем уточнения ансамбля. eLife 1 , e00311 (2012).

    Артикул Google ученый

  • Фредерик К.К., Марлоу М.С., Валентайн К.Г. и Ванд А.Дж. Конформационная энтропия при молекулярном распознавании белками. Природа 448 , 325–329 (2007).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Галле, Б.Гибкость и упаковка белков. Проц. Натл акад. науч. США 99 , 1274–1279 (2002).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Li, D. W. & Bru¨schweiler, R. Модель контакта всех атомов для понимания динамики белков на основе кристаллографических B-факторов. Биофиз. J. 96 , 3074–3081 (2009).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Рейли, А.М., Моррисон, К.А. и Рэнкин, Д.В.Х. Использование моделирования молекулярной динамики для понимания и улучшения обработки ангармонических колебаний. I. Исследование позиционных параметров. Acta Кристаллогр. А 67 , 336–345 (2011).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Рейли, А. М., Моррисон, К. А., Рэнкин, Д. В. и Маклин, К. Р. Использование моделирования молекулярной динамики для понимания и улучшения обработки ангармонических колебаний.II. Разработка и оценка новых факторов Дебая-Валлера. Acta Кристаллогр. А 67 , 346–356 (2011).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Клейвегт Г. и Джонс А. Хорошая практика построения и уточнения моделей. Method Enzymol 277 , 208–230 (1997).

    КАС Статья Google ученый

  • Бошан, К.А. и др. MSMBuilder2: моделирование конформационной динамики в масштабе от пикосекунды до миллисекунды. J. Chem. Теория вычисл. 7 , 3412–3419 (2011).

    КАС Статья Google ученый

  • Левин Э. Дж., Кондрашов Д. А., Везенберг Г. Э. и Филлипс Г. Н. Младший Уточнение ансамбля кристаллических структур белка: проверка и применение. Структура 15 , 1040–1052 (2007).

    КАС Статья Google ученый

  • Кубелка Ю., Чиу, Т.К., Дэвис, Д.Р., Итон, В.А. и Хофрихтер, Дж. Субмикросекундная укладка белков. Дж. Мол. биол. 359 , 546–553 (2006).

    КАС Статья Google ученый

  • Schuler, L., Daura, X. & van Gunsteren, W. F. Усовершенствованное силовое поле GROMOS96 для алифатических углеводородов в конденсированной фазе. Дж. Комп. хим. 22 , 1205–1218 (2001).

    КАС Статья Google ученый

  • Маргрейтер, К., Петров Д. и Загрович Б. Веб-сервер Vienna-PTM: набор инструментов для моделирования посттрансляционных модификаций белка методом МД. Рез. нуклеиновых кислот. 41 , W422–W426 (2013 г.).

    Артикул Google ученый

  • Петров Д., Маргрейтер К., Грандитс М., Остенбринк К. и Загрович Б. Систематическая основа для молекулярно-динамического моделирования посттрансляционных модификаций белков. Вычисление PLoS.биол. 9 , e1003154 (2013 г.).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Берендсен, Х. Дж. К., Постма, Дж. П. М., ван Гюнстерен, В. Ф. и Херманс, Дж. Модели взаимодействия воды в связи с гидратацией белка Рейдель (1981).

  • Хесс, Б., Куцнер, К., ван дер Споэль, Д. и Линдал, Э. GROMACS 4: алгоритмы для высокоэффективного, сбалансированного по нагрузке и масштабируемого молекулярного моделирования. J. Chem. Теория вычисл. 4 , 435–447 (2008).

    КАС Статья Google ученый

  • Черутти, Д. С., Фреддолино, П. Л., Дьюк, Р. Э. младший и Кейс, Д. А. Моделирование кристалла белка с рентгеновской структурой высокого разрешения: оценка силовых полей и моделей воды. J. Phys. хим. B 114 , 12811–12824 (2010).

    КАС Статья Google ученый

  • Берендсен, Х.Дж. К., Постма, Дж. П. М., ван Гюнстерен, В. Ф., ДиНола, А. и Хаак, Дж. Р. Молекулярная динамика с подключением к внешней ванне. J. Chem. физ. 81 , 3684–3690 (1984).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Хесс, Б., Беккер, Х., Берендсен, Х. и Фрайе, Дж. ЛИНК: Решатель линейных ограничений для молекулярного моделирования. Дж. Комп. хим. 18 , 1463–1472 (1997).

    КАС Статья Google ученый

  • Эссманн, У.и другие. Метод Эвальда для сетки с гладкими частицами. J. Chem. физ. 103 , 8577–8593 (1995).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Дарден, Т., Йорк, Д. и Педерсен, Л. Сетка частиц Эвальда — метод N-log(N) для сумм Эвальда в больших системах. J. Chem. физ. 98 , 10089–10092 (1993).

    КАС ОБЪЯВЛЕНИЯ Статья Google ученый

  • Винн, М.Д. и др. Обзор пакета CCP4 и текущих разработок. Acta Кристаллогр. Д 67 , 235–242 (2011).

    КАС Статья Google ученый

  • Агарвал, Р. Новый метод уточнения методом наименьших квадратов, основанный на алгоритме быстрого преобразования Фурье. Acta Кристаллогр. А 34 , 791–809 (1978).

    ОБЪЯВЛЕНИЕ Статья Google ученый

  • Брюнгер, А.T. Свободное значение R: новая статистическая величина для оценки точности кристаллических структур. Природа 355 , 472–475 (1992).

    ОБЪЯВЛЕНИЕ Статья Google ученый

  • Вагин А., Тепляков А. МОЛРЕП: автоматизированная программа молекулярной замены. J. Appl. Кристалл. 30 , 1022–1025 (1997).

    КАС Статья Google ученый

  • Силовое поле X – Примеры усовершенствования рентгеновского излучения

    Примеры уточнения рентгеновского излучения

    Предварительные условия для использования AMОЕBA-Assisted X-Ray Refinement

    Чтобы использовать уточнение рентгеновской кристаллографии с помощью AMОЕBA, Данные рентгеновского отражения должны быть предоставлены вместе с атомной моделью.В настоящее время принятые форматы включают:

    • Формат CCP4 MTZ (предпочтительно)
    • Формат CIF
    • ЦНС формат

    Если вы используете формат CIF, FFX попытается прочитать следующую информацию заголовка:

    • симметрия.Int_Tables_number или симметрия.space_group_name_H-M
    • ячейка
    • .длина_а, длина_b, длина_с, угол_альфа, угол_бета, угол_гамма
    • reflns.d_resolution_high
    • refln.status (для Rfree), F_meas_au и F_meas_sigma_au

    В качестве альтернативы, если вы используете файл CNS, FFX попытается чтобы прочитать информацию заголовка:

    В качестве альтернативы информация будет получена из КРИСТАЛЛА. информация заголовка в файле PDB предоставлена ​​для уточнения.

    Любая информация о данных (разрешение, целочисленный флаг Rfree, длины/углы ячеек) можно перезаписать, указав свойство файл.

    Имена/расширения файлов

    Координаты атомов лучше всего предоставлять в виде файла PDB для цели использования рентгеновского излучения (поскольку B-факторы и заселенность необходимо/актуально). Если координаты указаны в имя файла.pdb, то необязательный файл свойств может быть предоставлен как имя_файла.ключ или имя_файла.свойства. Этот файл свойств может содержат кристаллическую информацию, силовое поле и/или уточнение опции. Например:

                        ось а 39,767
                        ось b 51.750
                        ось с 132,938
                        альфа 90.00
                        бета 90.00
                        гамма 90.00
                        космическая группа P212121
                        разрешение 1.7
                        rfreeflag 1
                     

    Это переопределит любую информацию, полученную из PDB. файл или файл отражения.

    Для скриптов уточнения рентгена файлы отражений могут быть предоставляется в командной строке. Если указано только имя файла координат предоставлено, то программа будет искать действительное отражение файлы, используя базовое имя файла.В приведенном выше примере это будет в результате программа ищет filename.mtz, filename.ent/cif/sf и, наконец, имя файла.cns/hkl.

    Масштабирование данных/подгонка параметров sigmaA/выход MTZ

    xray.scaleBulk скрипт выполнит анизотропное масштабирование, подобрать объемный растворитель и вычислить кристаллографическую статистику (например, как R/Rfree) и записать файл MTZ без изменения входных данных. координаты, кроме добавления атомов водорода (при необходимости).Вот вывод из 2R4R:

                        Шкала от Fc до Fo: 0,56
                        Шкала сплайнов от Fc до Fo: 1,07 0,88 0,95 1,00 1,01 1,04 1,03 1,00 0,99 0,96
                        тензор анизо B:
                        -20,7258 0,00000 6,04607
                        0,00000 34,6983 0,00000
                        6,04607 0,00000 1,82392
                        модель объемного растворителя: полиномиальный переключатель
                        объемный растворитель a: 0,00000 w: 0.800000
                        шкала объемного растворителя: 0,440275 B: 106,995
                        -логарифмическая вероятность: 18883,5 (свободный набор: 2371,35)
    
                        Blow DPI (уравнение 7): 0,4694 атомов, отличных от H: 0,6628
                        DPI Круикшенка (уравнение 27): 0,4775 атомов, отличных от H: 0,6742
                        Acta Cryst (1999) D55, 583-601 и Acta Cryst (2002) D58, 792-797
    
                        # отражений (для 100% завершения): 19906
                        рез. диапазон | #HKL (R)|#HKL (резюме)| #бин | #промах |%завершено
                        85.923 7,475 | 1754 | 216 | 1970 | 20 | 98,99
                        7,473 5,886 | 1786 | 201 | 1987 | 4 | 99,80
                        5,886 5,125 | 1801 | 183 | 1984 | 5 | 99,75
                        5,124 4,643 | 1812 | 176 | 1988 | 1 | 99,95
                        4,643 4,303 | 1786 | 203 | 1989 | 5 | 99,75
                        4,303 4,041 | 1778 | 202 | 1980 | 12 | 99,40
                        4,041 3,838 | 1785 | 187 | 1972 | 20 | 99.00
                        3,838 3,668 | 1790 | 177 | 1967 | 25 | 98,74
                        3,668 3,524 | 1770 | 168 | 1938 | 46 | 97,68
                        3,524 3,400 | 1692 | 204 | 1896 | 97 | 95,13
                        85,923 3,400 | 17754 | 1917 | 19671 | 235 | 98,82
    
                        рез. диапазон | сигнал | сигма | с/н
                        85,923 7,475 | 441,80 | 10,74 | 43,62
                        7,473 5,886 | 271.55 | 11.56 | 28.46
                        5,886 5,125 | 286,52 | 15.06 | 23.59
                        5,124 4,643 | 315,70 | 16.80 | 22,69
                        4,643 4,303 | 296,68 | 18,65 | 19,82
                        4,303 4,041 | 257,25 | 21.41 | 15.34
                        4,041 3,838 | 207,39 | 25.19 | 10.32
                        3,838 3,668 | 183,12 | 27,91 | 7,95
                        3,668 3,524 | 162,23 | 30.25 | 6.23
                        3.524 3.400 | 146,64 | 33,67 | 4,97
                        85,923 3,400 | 258,28 | 20,80 | 18.39
    
                        s и w аналогичны D, а sum_wc - J. Appl. Кристалл. (2005) 38, 193-198
    
                        рез. диапазон | Р | Rбесплатно | с | ш(Э) | ш(Ф) | ФОМ
                        85,923 7,475 | 30.38 | 34,84 | 0,8436 | 0,2767 | 102.09 | 0,7142
                        7,473 5,886 | 22.53 | 27,91 | 0,8877 | 0,1970 | 43.06 | 0,7984
                        5.886 5,125 | 22.27 | 28,63 | 0,9093 | 0,2577 | 59.00 | 0,7610
                        5,124 4,643 | 17.59 | 22.31 | 0,9349 | 0,1406 | 35,53 | 0,8456
                        4,643 4,303 | 18.55 | 25,56 | 0,9255 | 0,1858 | 44,23 | 0,8104
                        4,303 4,041 | 19,65 | 24,96 | 0,9212 | 0,1970 | 40,53 | 0,7930
                        4,041 3,838 | 20.37 | 24,56 | 0,9297 | 0,1642 | 27.38 | 0,8280
                        3,838 3,668 | 22.52 | 26,61 | 0.8813 | 0,1709 | 24,83 | 0,8156
                        3,668 3,524 | 23,58 | 26.49 | 0,8607 | 0,1773 | 22.55 | 0,8098
                        3,524 3,400 | 28,58 | 32.32 | 0,8550 | 0,2956 | 33,27 | 0,7213
                        85,923 3,400 | 22,68 | 27,94 | 0,8952 | 0,2059 | 43,32 | 0,7900
                     

    Этот выход предоставляет все значения масштабирования, статистику данных и статистика модели по сравнению с данными, необходимая для выполнения быстрого анализ конструкции.(Необязательный) выходной файл MTZ содержит Коэффициенты Фурье (Fo-Fc и 2Fo-Fc), которые можно открывать автоматически в лысу, наряду с другими полезными коэффициентами (объемный растворитель и коэффициенты Fc, sigmaA, FOM и т. д.).

    Рентгеновское уточнение

    Механизм уточнения в FFX настроен на динамическую работу. Уточнение может включать имитацию отжига, уточнение координат только, только факторы B, заселенность, все три и т. д.Пример предоставляются сценарии для уточнения структуры рентгеновского снимка, хотя мы поощрять пользователей редактировать и изменять сценарии в соответствии с требованиями их задача.

    Например, для имитации отжига с последующим координировать, а затем уточнять B-фактор, предоставленный рентген.отжиг скрипта должно хватить. Задание можно запустить путем предоставления атомных координат и структурных факторов:

     fxc рентген.отжиг 1Н7С.пдб 1Н7С.мтз 

    Скрипт xray.anneal предоставляется в скриптах каталог. Запуск сценария с флагом -h распечатывает информация об использовании, воспроизведенная здесь:

                        использование: ffxc xray.anneal [параметры]  [имя файла данных]
                        -d,--data  указать имя файла входных данных (или просто
                        укажите аргумент datafilename после
                        файл PDB), вес применяется к
                        данные (wA), и если данные получены из
                        нейтронный эксперимент
                        -H,--высокая температура <1000.0> начальная температура
                        -h,--help Напечатать это справочное сообщение.
                        -L,--lowtemp <100.0> конечная температура
                        -n,--mdsteps <200> Количество шагов молекулярной динамики при
                        каждой температуры.
                        -N,--annealsteps <10> Количество шагов между высоким и низким
                        температура
                        -r,--mode <координаты> тип уточнения: [координаты /
                        bfactors/coordinates_and_bfactors/
                        занятия / bfactors_and_occupancies /
                        координаты_и_оккупаций /
                        координаты_и_bфакторы_и_занятости
                        ]
                        -s,--suffix <_anneal> выходной суффикс
                        -S,--scf отключает SCF/поляризацию
                     

    Таким образом, эквивалентным способом запуска сценария отжига будет:

     fxc рентген.отжиг -д 1Н7С.мтц,1.0,ложный 1Н7С.пдб 

    Флаг -d может присутствовать в команде несколько раз. линия, которую можно использовать для совместного нейтронно-рентгеновского уточнения.

    Скрипты, относящиеся к данным дифракции

    Как уже упоминалось, для использования предусмотрено несколько сценариев. Они можно найти здесь: включены сценарии дифракционных данных И состоит из:

    1. cif2mtz: конвертирует файл cif в файл mtz с симметрией информация, собранная из файла PDB
    2. дейтерат: заменяет атомы водорода на дейтерий (только если связан с N, O или S) и вода с дейтериевой водой для целей нейтронной очистки
    3. mtzInfo: распечатать информацию о файле MTZ
    4. рентген.отжиг: имитация отжига
    5. xray.minimize: оптимизация координат, Bs и занятости в любой комбинации (или все три могут быть выполняется по порядку)
    6. xray.scaleBulk: просто масштабируйте модель и данные, затем распечатать статистику и записать файл MTZ

    Аналогичные сценарии включены для реального пространства уточнение.

    Уточнение структуры

    Уточнение структуры

    Почему

    После того, как модель атома будет встроена в карту электронной плотности, или полученный путем молекулярной замены, вам необходимо оптимизировать его для наилучшего соответствия экспериментальных данных, сохраняя при этом хорошее согласие с предыдущими химические знания.

    Для кристаллографических данных этот процесс уточнения обычно выполняется в обратном пространстве. Используя цель наименьших квадратов или максимальную вероятность, параметры модели изменены, поэтому структурные факторы, полученные с помощью модели соответствуют амплитудам или интенсивностям экспериментальных структурных факторов.Например, эти параметры модели могут включать в себя (а) атомарные параметры, такие как координаты, параметры смещения атомов, заселенности и рассеяния факторы, и (б) неатомарные параметры, которые описывают вклады от объемный растворитель, двойникование и кристаллическая анизотропия.

    Как

    В Phenix основной программой для уточнения атомных моделей является феникс.уточнить . При этом применяются алгоритмы оптимизации (минимизация или имитация отжига) для изменения параметров модели (обычно координаты и параметры смещения атомов) для улучшения подгонки модель к данным.В то же время он налагает ограничения на предыдущие химическая информация (такая как длины связей, углы и кручения) для поддерживать хорошую стереохимию. Эта настраиваемая программа позволяет использовать несколько стратегии уточнения, которые можно комбинировать и применять к любой выбранной части модель за один проход.

    Как использовать графический интерфейс phenix.refine: Нажмите здесь

    Phenix справочное руководство для phenix.refine

    Общие вопросы

    Связанные программы

    • феникс.rosetta_refine: Это программа объединяет алгоритмы уточнения кристаллографической структуры от Phenix с физически реалистичными возможностями для модели оптимизация от Rosetta. Инструмент полезен при низком разрешении, где он сочетает в себе широкий радиус сходимости по различным локальным минимумам с реалистичной геометрией.
    • phenix.ensemble_refinement: Это программа сочетает кристаллографическое уточнение с молекулярной динамикой для производить ансамблевые модели, приспособленные к данным дифракции. Эти ансамблевые модели могут содержать ~50-500 отдельных структур и могут одновременно учитывать анизотопный и ангармонический атомарные дистрибутивы.
    • ERRASER: это еще один метод Rosetta, который выполняет перестройку структур РНК в реальном пространстве для улучшения геометрии и подходят к данным.

    Уточнение структуры монокристалла (SREF)

    Кристин М. Кларк, Университет Восточного Мичигана

    Карту электронной плотности, полученную в результате решения фазовой задачи, можно рассматривать как базовую карту структуры. Однако отнесение атомов к разным центрам интенсивности является ключом к пониманию структуры.Этап присвоения атомов называется решением кристаллической структуры . Процедура может быть загадочной для новичка, но достаточно проста. Существуют две основные процедуры структурных решений, которые будут обсуждаться ниже.

    Известный минерал

    Если образец представляет собой известные виды минералов, шаблон решенной структуры этого вида можно использовать для первоначального присвоения атомов. Это ускоряет решение, так как основные сайты могут быть назначены быстро. После того, как они были назначены, решение можно далее манипулировать, чтобы получить лучшее соответствие между наблюдаемыми (F(obs)) и расчетными (F(calc)) данными.Типичные шаги включают изменение занятости сайта, разделение занятости сайта между двумя элементами, разрешение сайтам стать анизотропными и обнаружение водорода. Поскольку водород является самым легким элементом, его может быть трудно найти в минералах со значительным содержанием «тяжелых» элементов. Небольшие изменения вносятся на каждом этапе, а затем выполняются циклы наименьших квадратов, которые пересчитывают структуру с использованием преобразований Фурье. Опытные переработчики, как правило, каждый раз выполняют одни и те же шаги.

    Неизвестный минерал

    Более сложным является, когда минерал неизвестен или представляет собой новый вид.Здесь нельзя использовать шаблон, и вместо этого элементы должны быть назначены на основе геометрии центров интенсивности и химического состава материала. Эта процедура может быть намного сложнее, так как часто путем «проб и ошибок» находится правильное назначение. Как только это произойдет, структура будет дополнительно уточнена, как описано выше.

    Результаты

    Результаты уточнения структуры дают список X-Y-Z отнесений атомов в элементарной ячейке, форму анизотропного центра интенсивности для каждого атома (тепловые параметры) и расстояние до ближайших соседей атомов.Кроме того, также дается угол между ближайшими соседями. Качество раствора оценивают по значениям R1, wR2 и GooF.
    • R1 , часто называемое значением R , является соответствием между расчетной и наблюдаемой моделями. Формула для этого значения: R1= |S |Fo|-|Fc| | / |S |Fo| |. Идеальные решения должны иметь R-значения, равные 0, однако из-за случайных ошибок это никогда не достигается. Значения R (указаны в процентах) менее 5% считаются хорошими растворами; Образцы высокого качества часто приводят к значениям R ниже 2.5%.
    • wR2 аналогичен R1, но относится к квадратичным значениям F. Это приводит к тому, что wR2 всегда имеет более высокое значение, чем R1.
    • Окончательное значение, GooF , относится к «правильности соответствия» решения. Помимо разницы в значениях F, GooF также учитывает количество наблюдаемых отражений и используемые параметры. В конце уточнения GooF должен приблизиться к 1.

    Программное обеспечение

    Уточнению структуры в значительной степени способствуют программные пакеты.Вероятно, наиболее широко используемым пакетом программного обеспечения является пакет программ SHELXTL. Различные программы в этом пакете, в том числе XPREP, XP и SHELXL, позволяют начальное решение фазовой проблемы, визуализацию кристалла и уточнение структуры.

    Ссылки:

    • Учебное пособие по SHELXTL, Геттингенский университет (http://shelx.uni-ac.gwdg.de/tutorial/english/intro.htm)

    Синхротронное рентгеновское исследование фрагментации и измельчения первичных интерметаллических частиц в сплаве Al-35 Cu, вызванное ультразвуковой обработкой расплава

    https://doi.org/10.1016/j.actamat.2017.09.010Получить права и содержание

    Abstract

    Используя синхротронную рентгеновскую высокоскоростную радиографию, фрагментация и уточнение ранее существовавших первичных интерметаллических дендритов Al 2 Cu, индуцированных ультразвуковой обработкой расплава в Заэвтектический сплав Al-35% Cu изучался на месте и в режиме реального времени. Сплав расплавляли, помещали и обрабатывали в кварцевом трубчатом тигле со средней частью канала толщиной примерно 300 мкм, где проводились наблюдения.Непосредственное наблюдение фрагментации и отрыва интерметаллидов однозначно подтверждает, что акустическая кавитация и струйное течение играют решающую роль в фрагментации интерметаллических дендритов. Кроме того, обнаружено, что эффект переплавления из-за переноса горячей жидкости акустическим потоком и нагрузка на интерметаллические дендриты, вызванная акустическим потоком, являются доминирующим механизмом фрагментации в настоящих экспериментах. Также предполагается, что кавитационные пузырьки или пузырьковые облака способствуют фрагментации не только за счет механического разрушения дендритов, но и за счет усиления воздействия акустического потока на дендриты.Наконец, четкое наблюдение равноосных интерметаллических дендритов, растущих из небольших фрагментов после ультразвуковой обработки расплава, дает первое убедительное свидетельство механизма измельчения, то есть акустическая кавитация и акустический поток постепенно разрушают интерметаллические дендриты на мелкие фрагменты.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.